En la casa de Ivan Petrovich Shuisky, en presencia de muchos clérigos y algunos boyardos, deciden divorciarse de Fyodor Ioannovich con la zarina, la hermana de Godunova, gracias a quien, según todos los informes, se mantiene a Boris. Inventan un papel donde, recordando la esterilidad de la reina y la infancia de Demetrio, le piden al rey que contraiga matrimonio. Golovin insinúa a Shuisky sobre la posibilidad de poner a Demetrius en lugar de Fedor, pero recibe un fuerte rechazo. La princesa Mstislavskaya lleva a los invitados y bebe la salud de Fedor. Shakhovsky, el novio de Mstislavskaya, el casamentero Volokhov llama al lugar de la reunión secreta. Ivan Petrovich envía una petición al Metropolitano, lamentando la necesidad de destruir a la reina. Fedyuk Starkov, su mayordomo, informa sobre lo que Godunov ha visto. Tras recibir de Uglich información sobre la relación de Golovin con Nagimi y ver una amenaza a su poder, anuncia a sus seguidores, Lup-Kleshnin y el Príncipe Turenin, la decisión de reconciliarse con Shuisky. Fyodor llega, quejándose de un caballo corzo. Aparece la zarina Irina, a quien Fedor informa pícaramente sobre la belleza Mstislavskaya, a quien vio en la iglesia, e inmediatamente le asegura a la zarina que ella es más hermosa para él que todos los demás. Godunov habla de un deseo de reconciliarse con Shuisky, y el zar con gusto aborda el asunto.
Fedor anuncia su intención de reconciliar a Godunov con Shuisky y le pide ayuda al metropolitano Dionisio y otros clérigos. Dionisio acusa a Godunov de oprimir a la iglesia, indulgente con los herejes y de reanudar la recaudación de impuestos de los cuales la iglesia fue liberada. Godunov le presenta cartas de protección e informes sobre la persecución de la herejía emprendida. El rey está pidiendo el apoyo de Irina y los boyardos. Acompañado por el entusiasmo popular, llega Ivan Petrovich Shuisky. Fedor le reprocha por no visitar la Duma, Shuisky se desanima por la imposibilidad de asentir a Godunov. Fiódor, recordando las Escrituras y llamando a los clérigos como testigos, habla de los beneficios de la reconciliación, y Godunov, obediente a él, ofrece el consentimiento de Shuisky. Shuisky lo reprocha por no querer compartir la administración estatal, que John legó a cinco boyardos: Zakharyin (fallecido), Mstislavsky (fuertemente amontonado), Belsky (exiliado), Godunov y Shuisky. Godunov, justificándose a sí mismo, habla de la arrogancia de Shuisky, de que utilizó el único poder en beneficio de Rusia, lo que también lo demuestra; agrega que la difícil tarea de poner en orden un estado frustrado era solo Shuysky. Y cuando Ivan Petrovich llama a su partidario Metropolitano, informa sobre las acciones de Godunov a favor de la iglesia y persuade a Shuisky a la paz. Irina, mostrando su cubierta bordada para el santuario de Pskov, admite que este es su voto de oración por la salvación de Shuisky, una vez asediada por los lituanos en Pskov. Un emocionado Shuisky está listo para olvidar su antigua enemistad, pero exige garantías de seguridad de Godunov para sus asociados. Godunov jura y besa la cruz. Invitan a los elegidos de la multitud traída por Shuisky. Fyodor habla con el anciano y no sabe cómo detenerlo, en su sobrino reconoce al comerciante Krasilnikov, quien recientemente lo estaba divirtiendo con una pelea de osos, recuerda a su hermano Golub, quien derrotó a Shakhovsky en puñetazos: Godunov y Shuisky no lograron devolver el zar a lo que los electores estaban llamados. . Shuisky anuncia una reconciliación con Godunov, los comerciantes están preocupados ("Estás reconciliando nuestras cabezas"), Shuisky está molesto por su desconfianza hacia la persona que acaba de jurar en la cruz. Los comerciantes piden protección al rey Godunov, pero él los envía a Boris. Boris ordena calladamente que escriba los nombres de los comerciantes.
Por la noche en el jardín de Shuysky, la princesa Mstislavskaya y Vasilisa Volokhova esperan a Shakhovsky. Él viene, habla sobre el amor, sobre la impaciencia con la que espera la boda, la ríe y bromea con ella. Krasilnikov viene corriendo, dejando entrar, Shakhovsky se esconde, llama a Ivan Petrovich e informa que todos los que estaban con el zar fueron capturados por orden de Godunov. Conmocionado, Shuisky le ordena a Moscú que se eleve a Godunov. Había insinuado que Dimitri Golovin se había interrumpido abruptamente y, diciendo que Boris se había engañado a sí mismo, fue al zar. Los boyardos restantes, mientras tanto, están discutiendo la petición, buscando una nueva reina. Vasily Shuisky llama a la princesa Mstislavskaya. Su hermano no decidió de inmediato, queriendo encontrar al menos una razón para una pelea con Shakhovsky. Mientras duda, Golovin escribe el nombre de la princesa en una petición. Shakhovskaya aparece, declarando que no va a renunciar a la novia. La princesa y Volokhova también se encuentran. Con un grito general, amenazas mutuas y reproches, Shakhovskaya toma una carta y huye. Godunov presenta a los documentos estatales del zar, cuyo contenido no aborda, pero está de acuerdo con las decisiones de Boris. La zarina Irina habla de una carta de Uglich de la Reina viuda con una solicitud para regresar con Dimitri a Moscú. Fedor estaba confiando el caso a Boris, pero Irina le exigió la solución del "asunto familiar"; Fedor discute con Boris y le molesta su tenacidad. Shuisky viene, se queja de Godunov. Él no desbloquea, explicando que los comerciantes no fueron tomados por el pasado, sino por tratar de alterar el mundo entre él y Shuisky. El zar está listo para perdonar a Godunov, creyendo que simplemente no se entendieron, pero la demanda implacable de dejar al príncipe en Uglich finalmente está enojado con el zar. Godunov dice que le está dando paso a Shuisky, Fedor le ruega que se quede, Shuisky, herido por el comportamiento del zar, se va. Kleshnin trae la carta de Golovin Nagim enviada desde Uglich, Godunov se la muestra al zar, exigiendo que Shuisky sea detenido y, posiblemente, ejecutado. En caso de fracaso, amenaza con irse. Conmocionado Fedor después de una larga vacilación rechaza los servicios de Godunov.
Ivan Petrovich Shuisky consuela a la princesa Mstislavskaya: no le permitirá casarse con el zar y espera que Shakhovskaya no les informe. Después de enviar a la princesa, acepta a los boyardos y a los fugitivos Krasilnikov y Dove, y, asumiendo la eliminación del empobrecido Fedor y la entronización de Demetrius, define las tareas de todos. La distante Godunov, sentada en su casa, le pregunta a Kleshnin sobre Volokhova y repite muchas veces, "para que ella prostituya al príncipe". Kleshnin envía a Volokhov a UGLICH una nueva madre, le ordena que se proteja y le sugiere que si el príncipe que sufre de un arroz se suicidará, no le preguntarán. Mientras tanto, Fedor no puede entender los documentos que se le presentaron. Kleshnin llega e informa que Boris se enfermó de frustración, y Shuisky debe ser encarcelado de inmediato por su intención de elevar a Demetrius al trono. Fedor no lo cree. Entra Shuisky, a quien Fedor habla de una denuncia y le pide que se justifique. El príncipe se niega, el rey insiste, empuja Kleshnin. Shuisky confiesa su rebelión. Fyodor, asustado de que Godunov castigue a Shuisky por traición, declara que él mismo ordenó poner al príncipe en el trono y expulsa al sorprendido Shuisky de la habitación. Shakhovskaya irrumpe en las cámaras reales y le pide que le devuelva la novia. Fedor, al haber visto la firma de Ivan Petrovich Shuisky, llora y no escucha los argumentos de Irina sobre lo absurdo del artículo. Protegiendo a Irina de los insultos, firma la orden de Borisov, aterrorizándola a ella y a Shakhovsky. En el puente sobre el río, el anciano alborota a la gente por Shuisky, el húsar canta sobre su valor. Un mensajero viaja con la noticia del avance de los tártaros. El príncipe Turenin con los arqueros lleva a Shuisky a prisión. La gente, abatida por el anciano, quiere liberar a Shuisky, pero él habla de su culpabilidad ante el "santo" rey y de que merece un castigo.
Kleshnin informa a Godunov que los Shuiskys y sus partidarios están encarcelados y presenta a Vasily Ivanovich Shuisky. Cambia el asunto como si hubiera iniciado una petición por el bien de Godunov. Entendiendo que Shuisky está en sus manos, Godunov lo deja ir. La zarina Irina intercede por Ivan Petrovich. Godunov, al darse cuenta de que Shuisky no dejará de discutir con él, es inflexible. En la plaza frente a la catedral, los mendigos hablan de un cambio en el área metropolitana que es objetable a Godunov, sobre la ejecución de los comerciantes que estaban detrás de Shuisky. La zarina Irina lleva a Mstislavskaya a preguntar por Shuisky. Fedor sale de la catedral, después de haber servido un réquiem por el zar Iván. La princesa se apresura a sus pies. Fedor envía al Príncipe Turenin por Shuisky. Pero Turenin informa que Shuisky se estranguló por la noche, se culpa a sí mismo por pasar por alto (porque golpeó a la multitud traída a la prisión por Shakhovsky, y golpeó solo disparando a Shakhovsky). Fedor se precipita hacia Turenin, acusándolo de matar a Shuisky, y lo amenaza con la ejecución. El mensajero trae una carta de Uglich sobre la muerte del príncipe. El rey sorprendido quiere descubrir la verdad por sí mismo. Llega un mensaje sobre el enfoque del Khan y un temprano asedio de Moscú. Godunov ofrece enviar a Kleshnin y Vasily Shuisky, y Fedor confía en la inocencia de Godunov. La princesa Mstislavskaya dice que tiene la intención de cortarse el pelo. Fyodor, por consejo de su esposa, transferirá toda la carga del gobierno a Boris y, recordando su intención de "ponerse de acuerdo en todo, suavizar todo", lamenta su destino y su deber real.
